Une étude mondiale du microbiome des sols viticoles met en évidence la dimension microbienne des terroirs viticoles

La biodiversité microbienne présente dans les différentes régions vitivinicoles est un déterminant important du terroir viticole. Elle doit être étudiée et préservée, bien qu'elle puisse, à l'avenir, être soumise à des manipulations par l'agriculture et l'œnologie de précision. Une étude globale des communautés microbiennes du sol des vignobles a été menée. Des échantillons de sol provenant de 200 vignobles sur quatre continents ont été analysés afin d'établir les bases du développement d'une carte du microbiome du sol des vignobles, représentant les modèles biogéographiques microbiens à l'échelle mondiale. Cette étude décrit les communautés microbiennes des vignobles dans le monde entier et établit des liens entre la localisation des vignobles et la biodiversité microbienne à différentes échelles : entre les continents, les pays et entre les différentes régions d'un même pays.

Les données climatiques corrélent avec la diversité alpha des champignons et non avec la diversité alpha des procaryotes, tandis que la distance spatiale, à l'échelle mondiale et nationale, est la principale variable expliquant la diversité bêta des communautés de champignons et de procaryotes. Les phyla Proteobacteria, Actinobacteria et Acidobacteria, et le genre Archaea Nitrososphaera dominent les communautés procaryotes dans les échantillons de sol tandis que la communauté fongique globale est dominée par les genres Solicoccozyma, Mortierella et Alternaria. Enfin, les données du microbiome ont été utilisées pour développer un modèle prédictif basé sur des analyses de forêt aléatoires pour discriminer entre les modèles microbiens et pour prédire la source géographique des échantillons avec une précision raisonnable.

Consultez l'article publié sur Communications Biology en langue anglaise sous le titre "A global microbiome survey of vineyard soils highlights the microbial dimension of viticultural terroirs", mars 2022

Source: Communications Biology